該劇是以單元的劇式對狄仁杰偵破案件的故事進行全新的揭秘與解讀，講述了破獲以情花案和金人案為代表的一連串謎案的故事。

一朵瓊花帶血復生，引出前朝復仇之謀；十二銅人蝕骨熔金，原是天樞殺機之謎；大案彌天，對手詭譎；狄公重臨，匡扶正義；武朝迷案未了，狄仁杰重出江湖；神探經典，精彩再現。



《瓊花案》：唐武周年間，揚州瓊花觀獨一無二的一株瓊花本已枯死，竟意外復生，且花中似有血色，一時間謠諑紛紜。

武則天派太子李旦前往揚州，明為敕封瓊花實則驅謠辟邪。

太子到達揚州后竟意外失蹤，狄仁杰、李元芳受命前往揚州調查。

揚州城里卻是芳齡少女接連被殺、西漢古墓疑似鬧鬼、風流巨賈之妻突然失蹤，案情詭譎，迷離百變。

狄公認為，這些事件都不是孤立的，而是驚天陰謀的一部分……

《金人案》：京畿震后，武皇花園內一棵青銅樹因震出土，人心惶惶，武皇急召狄仁杰進京議事。

青銅樹上密文顯示武皇陰柔氣重，需鑄天樞輔以金人十二圍繞，并于頂部建造太陽神鳥方可解此大難。

武皇孤意制造天樞，命狄仁杰解開太陽神鳥之謎。

然則，建造天樞卻引出一樁樁離奇謎案，武氏弟子運送銅料卻盡數失蹤、黃金谷里機關重重波斯美人引得盲眼畫師命喪他鄉、易大洪袒露蝕骨熔金之法暴斃……

經過一番艱苦卓絕的探查，真相終于浮出水面，原來，這場蓄謀已久的大陰謀，最終的目的竟是……